Tem se tornado comum nas escolas de níveis fundamental e médio a prática da iniciação científica, na qual estudantes desenvolvem pesquisas. Entretanto, se faz necessária uma revisão teórica quanto à concepção de pesquisa nestes níveis, com vistas a garantir que os trabalhos desenvolvidos por professores e estudantes sejam elaborados segundo os pressupostos teóricos para os quais se atribui o valor de pesquisa científica. Nesse sentido, o presente minicurso – dividido em dois módulos – tem como objetivo refletir sobre os fundamentos epistemológicos da pesquisa científica e a formulação de uma proposta de organização da iniciação científica na escola. Ao final do minicurso espera-se que os participantes tenham desenvolvido uma consciência crítica sobre a pesquisa científica e como se deve conceber a pesquisa nos níveis fundamental e médio, além da habilidade para o planejamento das práticas escolares da pesquisa científica.